2006年1月，由武书连领衔的《中国大学评价》课题组发表了2006年中国一流大学名单。
　　 《中国大学评价》课题组认为：中国一流大学是中国的顶尖大学，代表中国大学各学科门类最高学术水平。对于应届高中毕业生来说，平时学习成绩优异，希望进入国内最好的大学接受最好的专业教育，将来成为中国社会的精英。可报考中国一流大学最好的专业。
　　 《中国大学评价》课题组提出的2006年度中国一流大学的标准与上年相同，即：“1、在中国大学评价中，获得工学前6名、理学、医学、管理学、文学前3名、农学、经济学、法学前2名、历史学、教育学、哲学第1名的大学。2、必须是中国研究型大学。”
　　 按照以上标准，2006年中国有15所大学入选中国一流大学，数量与名单都与上年相同，区别在于：北京大学医学从第二名上升到第一名，中国协和医科大学医学由第一名降为第二名；清华大学管理学从第三名上升到第二名，浙江大学管理学由第二名降为第三名；天津大学工学从第六名上升为第五名，华中科技大学工学由第五名降为第六名。
　　 在11个学科门类中，北京大学获得理学、医学、文学、法学、哲学五个第一名。北京大学的经济学、历史学也具备获得第一名的师资力量。
　　 2006年农学第2名是南京农业大学，但因南农的科研成果总量没有达到研究型大学的标准而没有进入中国一流大学。
　　 2006中国一流大学名单（共15所）
　　

　　清华大学 工学第一名、管理学第二名
　　 清华大学 是中国最优秀的大学，与北京大学同为国家优先发展的两所大学，工学类，研究1型。清华大学以工学第一名、管理学第二名进入中国一流大学，总分列全国大学第1名。清华大学在7个学科门招收本科生，其中工学、管理学为A++级，理学、法学、文学为A+级，经济学为A级。清华大学在56个专业招收本科生，其中文学的编辑出版学、艺术类新专业W、艺术设计学、广告学、绘画、雕塑专业，理学的物理学类新专业W、应用物理学、微电子学、信息与计算科学、生物科学、数学与应用数学、生物技术专业，工学的高分子材料与工程、材料科学与工程Y、机械类新专业W、车辆工程W、测控技术与仪器、核工程与核技术、电气信息类新专业W、电气工程及其自动化、自动化、电子信息工程、土建类新专业W、建筑学Y、土木工程Y、建筑环境与设备工程、给水排水工程、水利类新专业W、水利水电工程、环境工程、工程力学、机械工程及自动化Y、计算机科学与技术、电子科学与技术、生物医学工程、软件工程W专业，管理学的信息管理与信息系统、工业工程、工商管理专业是A++级。清华大学工学、管理学实力超群，是造就工学、管理学一流人才的理想之地。理学、法学、文学实力雄厚，是培养理学、法学、文学杰出人才的优秀大学。经济学实力上乘，是培养经济学优秀人才的高等学府。
　　 北京大学 理学第一名、医学第一名、哲学第一名、文学第一名、法学第一名、经济学第二名
　　 北京大学是中国最著名的大学，与清华大学同为国家优先发展的两所大学，综合类，研究1型。北京大学以理学第一名、医学第一名、哲学第一名、文学第一名、法学第一名、经济学第二名进入中国一流大学，总分列全国大学第2名。北京大学在9个学科门招收本科生，其中理学、医学、哲学、法学、文学、经济学、历史学、管理学为A++级，工学为A级。北京大学在96个专业招收本科生，其中哲学的哲学类新专业W、哲学、逻辑学专业，经济学的金融学、保险W、经济学专业，法学的科学社会主义与国际共产主义运动、社会学、社会工作、政治学类新专业W、政治学与行政学、国际政治、法学专业，文学的法语、西班牙语、波斯语、菲律宾语、梵语巴利语、印地语、缅甸语、蒙古语、乌尔都语、希伯莱语、中国语言文学类新专业W、汉语言、古典文献、英语、德语、日语、广播电视编导、汉语言文学专业，历史学的考古学、博物馆学、世界历史专业，理学的数学类新专业W、数学与应用数学、信息与计算科学、化学、生物科学、生物技术、地理科学类新专业W、大气科学、力学类新专业W、电子信息科学与技术、环境科学类新专业W、环境科学、心理学类新专业W、统计学、物理学、天文学、地理科学、地理信息系统、理论与应用力学、微电子学、心理学、材料化学、资源环境与城乡规划管理专业，工学的计算机科学与技术专业，医学的基础医学类新专业W、基础医学、预防医学类新专业W、预防医学、药学、临床医学、医学检验专业，管理学的财务管理、图书馆学、市场营销、人力资源管理、行政管理、工商管理、公共事业管理专业是A++级。北京大学理学、医学、哲学、法学、文学、经济学、历史学、管理学实力超群，是造就理学、医学、哲学、法学、文学、经济学、历史学、管理学一流人才的理想之地。工学实力上乘，是培养工学优秀人才的高等学府。

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文章：中华网教育